Genetic relationships of the Yucatan black hairless pig with Iberian breeds using single nucleotide polymorfisms / Relações genéticas de porcos pretos calvos de Yucatán com raças ibéricas usando Polimorfismo de nucleotídeos isolados

To conduct ex-situ creole pig conservation programs, it is essential to determine which breeding animals will be used, preferentially those with a more significant Iberian genetic component to preserve their origin. This study used a Yucatan black hairless pigs (YBHP) subpopulation to estimate its genetic diversity and population structure. One hundred four adult pigs were selected for the absence of hair, black skin (without spots), black hoof, and straight snout. The porcine-GGP-50K chip was used for SNP genotyping in YBHP, and information on Iberian and Yucatán hairless pigs from the United States (USYU) was taken from databases. All analysis was performed using PLINK v1.9 and v2.1 software. Inbreeding and fixation index values were lower in YBHP, with high observed heterozygosity and allogamy index values, which agree with those obtained in the populations of Canarias and Chato Murciano. According to the clusters generated by the "Genome-Wide Identity by State" analysis, four groups were identified, one of which included pigs from Guadyerbas, USYU, and YBHP. Between populations, YBHP was closely related to the hairless pigs from Guadyerbas, USYU, and Canarias. Principal component analysis showed the same result. According to the results obtained from the runs of homozygosity investigation, aimed to get pools consensus of regions of overlapping, 119 SNPs associated with genes and biological processes were identified. The BMP7 and NSUN2 genes were associated with epithelial cell differentiation, morphogenesis, and epithelial development. For nutrient metabolism: energy, the HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1, and FAT 1genes were identified.(AU)

Para realizar programas de conservação ex-situ de suínos crioulos, é importante determinar quais animais serão criados, preferencialmente aqueles com maior componente de genética ibérica, para preservar sua origem. Uma subpopulação de porco preto calvo de Yucatán (YBHP) foi usada para estimar sua diversidade genética e estrutura populacional. Um total de 104 suínos adultos foram selecionados levando-se em consideração características como ausência de pelos, pele preta (sem manchas), casco preto e focinho reto. O painel GGP-50K foi utilizado para a genotipagem dos SNPs em animais YBHP, e informações de porcos sem pelos ibéricos e de Yucatán dos Estados Unidos (USYU) foram retiradas de bancos de dados. Todas as análises foram realizadas com o software PLINK v1.9 e v2.1. Os valores dos índices de endogamia e fixação foram menores em YBHP, com altos valores de índice de heterozigosidade e alogamia observados, que concordam com os obtidos nas populações de Canárias e Chato Murciano. De acordo com os clusters gerados pela análise "Genoma-Wide Identity By State", quatro grupos foram identificados, um dos quais incluiu porcos de Guadyerbas, USYU e YBHP. Entre as populações, YBHP estava intimamente relacionado com os porcos sem pelo de Guadyerbas, USYU e Canárias. A análise de componentes principais mostrou o mesmo resultado. De acordo com os resultados obtidos nas corridas de investigação de homozigose, visando obter consenso de pools de regiões de sobreposição, foram identificados 119 SNPs associados a genes e processos biológicos. Os genes BMP7 e NSUN2 foram associados à diferenciação de células epiteliais, morfogênese e desenvolvimento epitelial. Para metabolismo de nutrientes: energia, os genes HADHA, PPARA, ADD1/SREBF1 e FAT1 foram identificados.(AU)

Prevalencia, caracterización y extensión de las lesiones en pulmones de cerdos sacrificados en el rastro municipal de Mérida, Yucatán, México / Prevalence, characterization and degree of lesions in pig lungs in the municipal slaughterhouse of Merida, Yucatan, México

Introducción.- El complejo respiratorio ha sido identificado como el principal síndrome que afecta al ganado porcino, se encuentra asociado a pérdidas en la ganancia de peso, eficiencia alimenticia, y mortalidad. Con base en lo anterior se plantea los siguientes objetivos: a) Determinar la prevalencia de lesiones pulmonares en cerdos sacrificados en el rastro municipal de Mérida, Yucatán, México; b) Caracterizar anatomopatológicamente las lesiones pulmonares, y c) Determinar el grado de extensión de las lesiones pulmonares. Materiales y métodos.- En el rastro municipal de Mérida, Yucatán, México, se inspeccionaron macroscópicamente los pulmones de los cerdos para identificar los tipos de lesión y evaluar el grado de extensión de la lesión.Resultados.- La prevalencia de lesiones pulmonares fue 90.3 por ciento (11,895 pulmones). La pleuroneumonía se presentó en 37.1 por ciento (4,418) de los pulmones, bronconeumonía en 28.9 por ciento (3,433), neumonía en 28.0 por ciento (3,329) y pleuritis en 6.0 por ciento (715) de los pulmones. En el 56.5 por ciento (304) de los pulmones se presentó un grado de extensión de la lesión pulmonar igual o menor al 10 por ciento y en el 43.5 por ciento (234) de los pulmones mayor al 10 por ciento. De los pulmones inspeccionados para evaluar el grado de extensión de la lesión, el 43.5 por ciento tuvo más del 10 por ciento del pulmón afectado. Discusión.- Los tipos y grado de extensión de las lesiones se puede deber a varios factores entre los que se encuentran el sistema de producción, medidas de bioseguridad, nutrición, ambiente y microbismo ambiental. La prevalencia alta indica la importancia que tiene el complejo respiratorio en el estado de Yucatán. Los tipos de lesión pulmonar, sugieren la presencia de algunos microorganismos del complejo respiratorio.